為提昇教育品質，有效紓解馬公國中班級人數壓力，並配合政府推行「小班小校」之教育政策，及考慮馬公市區尚無國中之困擾暨社區之需要，於中華民國八十三年奉准在馬公市文光路17號之文教用地「文二中」籌設馬公第二國中。繼於民國八十六年奉准自八十七學年開始招生設校---「文光國中」，同時調派中正國中校長兼本校籌備主任胡福氣先生為本校首任校長；91年2月1日由教務主任謝嘉貞兼代理校長；91年8月1日調派許德便校長掌理校務4年；95年8月1日楊啟清校長調派本校掌理校務3年半；99年2月1日由教務主任葉天文兼代理校長；99年8月1日郭文耀校長調派本校掌理校務5年；104年8月1日黃光孝校長調派本校掌理校務2年半；107年2月由教務主任陳政一兼代理校長；107年8月1日仰瓊宜校長調派本校掌理校務6年；113年8月1日葉天文校長調派文光國中。

       本校面積共計二.五七一公頃，為本縣唯一一所市區國中。學區包括馬公市區之新復、復興、中央、啟明、長安、重慶、中興、光榮、重光等十里，並劃陽明路以南、永安街以西、大勇路以南、中華路以西、治平路以北、光復路以東之地區為自由學區。

       本校現有建物：教學區域計有普通教室廿四間、行政辦公室十三間、專科教室十五間、午餐廚房一座。活動區域包括操場、集合活動一處、籃球場二座、涼亭乙座和學生活動中心，朝充實教學設備目標邁進。107年開始因應12年國教建置生活科技教室相關設備，並申請社區共讀站計畫改建圖書室、共讀中心成為更優質的學習場域。

       文光國中自87年設校開始於10年內壯大為班級數達30班的大型學校，但因各項因素逐漸減少班級數不到全盛時期的一半，雖然逐漸穩定卻因為少子化的衝擊使得班級數無法再創高峰。但是文光在這段蛻變的過程中，我們了解唯有師資穩定、教學目標明確並且有創新的思考才能吸引學生就讀。

               澎湖縣教育網路中心設於本校，因此資訊教育之推廣乃成為本校之重要目標，也獲得教育部評比為行動學習教育全國優良學校，也是全國少數推廣學校之一，對改變學生學習模式有所幫助。另各領域開始進行分組合作學習等教學方式改變的嘗試，並且開放教室共同備課，以符應十二年國教精神。

      100年開始積極推動節能減碳，建設低碳校園。目前已設置太陽能光電、中水回收、節能燈具及能源監控系統，低碳教學亦成為本校特色。本校舞蹈班亦於100年成立，每年參加全縣、全國舞蹈比賽均獲得優等佳績，對於舞蹈教育的推廣不遺餘力，每年5月5日舞蹈節前後都會辦理成果發表會。102年規劃綜合領域考驗為校本課程，以童軍為主軸、家政為輔規劃於每年期末進行全校課程考驗，並配合春季戶外教學規劃七年級追蹤旅行活動，讓學生學以致用。

       102年成立資源班讓需要特殊教育服務的學生可以有更適性的教學課程，實踐公平。學年度配課及編班安排皆先考慮資源班學生之需求，期能與普通班學生有公平的學習基點。自108學年執行新課綱的推動，本校謹慎執行素養導向教學課程，充實教學軟、硬體以提升教學品質，支持教師社群共同備課及進修，且辦理彈性課程教學分享研習，期能規劃跨領域校本課程以激發學生潛能。在師生之配合、支持與努力下，文光國中逐步成為學子之理想學習園地也邁向青壯期。

      面對十二年國民基本教育的來臨，這是文光展現能力的契機。這幾年在團隊的努力下，我們獲得外界諸多的掌聲，在少子化的衝擊下能逆勢增班，表示我們為學生規劃的各項學習活動獲得認可。雖然升學制度是國中教育不可擺脫的問題，也深切的影響文光。但是讓學生學會如何學習，才是文光團隊關注的核心問題。